Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prim1P20664 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prim1P20664 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prim1P20664 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prim1P20664 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prim1P20664 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prim1P20664 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prim1P20664 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prim1P20664 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prim1P20664 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prim1P20664 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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