Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VimP20152 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VimP20152 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VimP20152 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VimP20152 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VimP20152 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VimP20152 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VimP20152 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VimP20152 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VimP20152 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VimP20152 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VimP20152 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VimP20152 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VimP20152 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VimP20152 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VimP20152 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VimP20152 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VimP20152 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VimP20152 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VimP20152 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VimP20152 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VimP20152 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VimP20152 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VimP20152 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VimP20152 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VimP20152 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VimP20152 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VimP20152 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VimP20152 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VimP20152 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VimP20152 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VimP20152 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VimP20152 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VimP20152 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VimP20152 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VimP20152 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VimP20152 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VimP20152 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VimP20152 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VimP20152 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VimP20152 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VimP20152 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VimP20152 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VimP20152 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VimP20152 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VimP20152 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VimP20152 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VimP20152 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VimP20152 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VimP20152 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VimP20152 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VimP20152 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VimP20152 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VimP20152 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VimP20152 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VimP20152 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VimP20152 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VimP20152 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VimP20152 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VimP20152 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VimP20152 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VimP20152 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VimP20152 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VimP20152 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VimP20152 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VimP20152 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VimP20152 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VimP20152 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VimP20152 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VimP20152 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VimP20152 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VimP20152 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VimP20152 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VimP20152 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VimP20152 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VimP20152 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VimP20152 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VimP20152 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VimP20152 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VimP20152 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VimP20152 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VimP20152 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VimP20152 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VimP20152 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VimP20152 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VimP20152 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VimP20152 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VimP20152 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VimP20152 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VimP20152 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VimP20152 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VimP20152 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VimP20152 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VimP20152 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VimP20152 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VimP20152 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VimP20152 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VimP20152 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VimP20152 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
VimP20152 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms