Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P20040 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P20040 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P20040 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P20040 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P20040 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P20040 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P20040 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P20040 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P20040 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P20040 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P20040 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P20040 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P20040 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P20040 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P20040 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P20040 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P20040 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P20040 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P20040 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P20040 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P20040 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P20040 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P20040 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P20040 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P20040 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P20040 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P20040 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P20040 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P20040 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P20040 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P20040 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P20040 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P20040 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P20040 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P20040 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P20040 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P20040 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P20040 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P20040 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P20040 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P20040 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P20040 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P20040 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P20040 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P20040 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P20040 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P20040 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P20040 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P20040 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P20040 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P20040 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P20040 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P20040 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P20040 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P20040 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P20040 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P20040 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P20040 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P20040 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P20040 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P20040 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P20040 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P20040 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P20040 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P20040 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P20040 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P20040 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P20040 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P20040 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P20040 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P20040 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P20040 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P20040 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P20040 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P20040 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P20040 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P20040 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P20040 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P20040 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P20040 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P20040 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P20040 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P20040 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P20040 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P20040 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P20040 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P20040 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P20040 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P20040 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P20040 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P20040 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P20040 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P20040 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P20040 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P20040 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P20040 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P20040 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P20040 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P20040 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms