Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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