Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms