Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lama1P19137 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama1P19137 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama1P19137 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lama1P19137 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama1P19137 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lama1P19137 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lama1P19137 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lama1P19137 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lama1P19137 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lama1P19137 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lama1P19137 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama1P19137 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lama1P19137 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms