Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
P18530 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18530 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18530 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18530 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18530 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18530 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18530 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18530 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18530 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18530 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18530 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18530 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18530 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18530 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18530 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18530 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18530 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18530 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18530 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18530 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18530 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18530 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18530 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18530 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18530 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
P18530 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18530 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18530 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18530 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18530 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18530 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18530 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18530 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18530 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18530 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18530 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18530 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18530 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18530 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18530 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18530 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18530 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18530 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18530 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18530 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18530 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18530 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18530 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18530 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18530 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18530 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18530 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18530 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18530 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18530 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18530 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
P18530 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18530 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18530 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18530 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18530 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18530 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18530 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18530 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18530 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18530 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P18530 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P18530 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P18530 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P18530 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P18530 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P18530 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P18530 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P18530 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P18530 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
P18530 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P18530 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P18530 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P18530 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P18530 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P18530 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P18530 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P18530 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P18530 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P18530 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P18530 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P18530 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P18530 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P18530 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P18530 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P18530 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P18530 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P18530 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P18530 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P18530 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P18530 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P18530 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
P18530 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P18530 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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