Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SptbP15508 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SptbP15508 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SptbP15508 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SptbP15508 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SptbP15508 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SptbP15508 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SptbP15508 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SptbP15508 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SptbP15508 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SptbP15508 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SptbP15508 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SptbP15508 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SptbP15508 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SptbP15508 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SptbP15508 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SptbP15508 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SptbP15508 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SptbP15508 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SptbP15508 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SptbP15508 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SptbP15508 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SptbP15508 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SptbP15508 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SptbP15508 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SptbP15508 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SptbP15508 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SptbP15508 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SptbP15508 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SptbP15508 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SptbP15508 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SptbP15508 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SptbP15508 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SptbP15508 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SptbP15508 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SptbP15508 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SptbP15508 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SptbP15508 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SptbP15508 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SptbP15508 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SptbP15508 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SptbP15508 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SptbP15508 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SptbP15508 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SptbP15508 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SptbP15508 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SptbP15508 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SptbP15508 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SptbP15508 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SptbP15508 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SptbP15508 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SptbP15508 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SptbP15508 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SptbP15508 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SptbP15508 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SptbP15508 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SptbP15508 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SptbP15508 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SptbP15508 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SptbP15508 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SptbP15508 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SptbP15508 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SptbP15508 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SptbP15508 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SptbP15508 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SptbP15508 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SptbP15508 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SptbP15508 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SptbP15508 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SptbP15508 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SptbP15508 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SptbP15508 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SptbP15508 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SptbP15508 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SptbP15508 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SptbP15508 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SptbP15508 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SptbP15508 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SptbP15508 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SptbP15508 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SptbP15508 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SptbP15508 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SptbP15508 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SptbP15508 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SptbP15508 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SptbP15508 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SptbP15508 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SptbP15508 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SptbP15508 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SptbP15508 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SptbP15508 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SptbP15508 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SptbP15508 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SptbP15508 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SptbP15508 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SptbP15508 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SptbP15508 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SptbP15508 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SptbP15508 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SptbP15508 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms