Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf1P15314 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf1P15314 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf1P15314 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf1P15314 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf1P15314 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf1P15314 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf1P15314 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms