Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb2P13373 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vpreb2P13373 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms