Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms