Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calb1P12658 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calb1P12658 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Calb1P12658 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calb1P12658 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Calb1P12658 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calb1P12658 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calb1P12658 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms