Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrm1P12657 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms