Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PolP11369 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PolP11369 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PolP11369 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PolP11369 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PolP11369 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PolP11369 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PolP11369 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PolP11369 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PolP11369 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PolP11369 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PolP11369 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PolP11369 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PolP11369 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PolP11369 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PolP11369 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PolP11369 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PolP11369 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PolP11369 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PolP11369 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PolP11369 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PolP11369 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PolP11369 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PolP11369 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PolP11369 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PolP11369 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PolP11369 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PolP11369 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PolP11369 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PolP11369 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PolP11369 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PolP11369 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PolP11369 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PolP11369 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PolP11369 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PolP11369 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PolP11369 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PolP11369 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PolP11369 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PolP11369 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolP11369 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolP11369 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolP11369 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolP11369 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolP11369 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolP11369 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolP11369 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolP11369 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolP11369 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolP11369 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PolP11369 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PolP11369 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PolP11369 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolP11369 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolP11369 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolP11369 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolP11369 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolP11369 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolP11369 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolP11369 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolP11369 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PolP11369 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PolP11369 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PolP11369 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PolP11369 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PolP11369 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PolP11369 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PolP11369 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PolP11369 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PolP11369 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PolP11369 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PolP11369 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PolP11369 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PolP11369 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PolP11369 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PolP11369 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PolP11369 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PolP11369 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PolP11369 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PolP11369 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PolP11369 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PolP11369 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PolP11369 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PolP11369 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolP11369 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolP11369 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolP11369 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolP11369 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PolP11369 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolP11369 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolP11369 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolP11369 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolP11369 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolP11369 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolP11369 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolP11369 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolP11369 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolP11369 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolP11369 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolP11369 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms