Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spp1P10923 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spp1P10923 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spp1P10923 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spp1P10923 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms