Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nid1P10493 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nid1P10493 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nid1P10493 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nid1P10493 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nid1P10493 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nid1P10493 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nid1P10493 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nid1P10493 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nid1P10493 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nid1P10493 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nid1P10493 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nid1P10493 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nid1P10493 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nid1P10493 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nid1P10493 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nid1P10493 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nid1P10493 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nid1P10493 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nid1P10493 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nid1P10493 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nid1P10493 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nid1P10493 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nid1P10493 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nid1P10493 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nid1P10493 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nid1P10493 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms