Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Myod1P10085 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Myod1P10085 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Myod1P10085 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Myod1P10085 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Myod1P10085 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Myod1P10085 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms