Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc9P09633 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc9P09633 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms