Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxa9P09631 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms