Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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