Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxc8P09025 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc8P09025 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms