Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TnfP06804 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TnfP06804 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TnfP06804 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TnfP06804 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TnfP06804 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TnfP06804 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TnfP06804 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TnfP06804 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TnfP06804 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TnfP06804 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TnfP06804 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TnfP06804 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TnfP06804 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TnfP06804 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TnfP06804 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TnfP06804 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TnfP06804 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TnfP06804 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TnfP06804 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TnfP06804 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TnfP06804 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TnfP06804 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TnfP06804 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TnfP06804 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TnfP06804 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TnfP06804 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TnfP06804 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TnfP06804 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TnfP06804 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TnfP06804 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TnfP06804 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TnfP06804 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TnfP06804 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TnfP06804 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TnfP06804 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TnfP06804 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TnfP06804 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TnfP06804 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TnfP06804 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TnfP06804 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TnfP06804 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TnfP06804 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TnfP06804 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TnfP06804 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TnfP06804 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TnfP06804 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TnfP06804 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TnfP06804 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TnfP06804 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TnfP06804 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TnfP06804 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TnfP06804 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TnfP06804 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TnfP06804 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
TnfP06804 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TnfP06804 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TnfP06804 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TnfP06804 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TnfP06804 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TnfP06804 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TnfP06804 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TnfP06804 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TnfP06804 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TnfP06804 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TnfP06804 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TnfP06804 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TnfP06804 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TnfP06804 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TnfP06804 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TnfP06804 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TnfP06804 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TnfP06804 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TnfP06804 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TnfP06804 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TnfP06804 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TnfP06804 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TnfP06804 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TnfP06804 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TnfP06804 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TnfP06804 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TnfP06804 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TnfP06804 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TnfP06804 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TnfP06804 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TnfP06804 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TnfP06804 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TnfP06804 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TnfP06804 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TnfP06804 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TnfP06804 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TnfP06804 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TnfP06804 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TnfP06804 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TnfP06804 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TnfP06804 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TnfP06804 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TnfP06804 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TnfP06804 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TnfP06804 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms