Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04213 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04213 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04213 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P04213 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P04213 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04213 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04213 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04213 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04213 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04213 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04213 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04213 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04213 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04213 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04213 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04213 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04213 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04213 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04213 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04213 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04213 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04213 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04213 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04213 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04213 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04213 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04213 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04213 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P04213 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04213 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04213 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04213 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04213 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04213 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04213 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04213 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04213 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04213 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04213 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04213 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04213 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04213 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04213 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P04213 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04213 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04213 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04213 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04213 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04213 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04213 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04213 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04213 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04213 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04213 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04213 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04213 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04213 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04213 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P04213 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04213 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04213 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04213 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04213 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04213 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04213 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04213 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04213 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04213 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04213 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04213 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04213 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04213 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04213 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04213 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04213 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04213 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04213 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04213 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04213 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04213 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04213 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04213 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04213 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04213 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04213 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04213 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P04213 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P04213 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P04213 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P04213 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P04213 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P04213 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P04213 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P04213 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P04213 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P04213 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P04213 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P04213 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P04213 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms