Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb1P04202 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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