Protein–RNA interactions for Protein: P01851

T-cell receptor beta-2 chain C region, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01851 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01851 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01851 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01851 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01851 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01851 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01851 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01851 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01851 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01851 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01851 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01851 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01851 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01851 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01851 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01851 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01851 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01851 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01851 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01851 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01851 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01851 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01851 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01851 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01851 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01851 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01851 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01851 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01851 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01851 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01851 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01851 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01851 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01851 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01851 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01851 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01851 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01851 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01851 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01851 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01851 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01851 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01851 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01851 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01851 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01851 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01851 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01851 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01851 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01851 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01851 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01851 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01851 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01851 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01851 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01851 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01851 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01851 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01851 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01851 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01851 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01851 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01851 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01851 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01851 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01851 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01851 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01851 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01851 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01851 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01851 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01851 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01851 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01851 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01851 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01851 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01851 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01851 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01851 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01851 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01851 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01851 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01851 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01851 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01851 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01851 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01851 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01851 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01851 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01851 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01851 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01851 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01851 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01851 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01851 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01851 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01851 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01851 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
P01851 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01851 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms