Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01678 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01678 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01678 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01678 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01678 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01678 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01678 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01678 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01678 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01678 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01678 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01678 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01678 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01678 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01678 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01678 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01678 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01678 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01678 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01678 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01678 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01678 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01678 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01678 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01678 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01678 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01678 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01678 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01678 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01678 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01678 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01678 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01678 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01678 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01678 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01678 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01678 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01678 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01678 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01678 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01678 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01678 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01678 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01678 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01678 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01678 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01678 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01678 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01678 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01678 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01678 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01678 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01678 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01678 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01678 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01678 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01678 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01678 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01678 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01678 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01678 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01678 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01678 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01678 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01678 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01678 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01678 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01678 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01678 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01678 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01678 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01678 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01678 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01678 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01678 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01678 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01678 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01678 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01678 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01678 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01678 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01678 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01678 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01678 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01678 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01678 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01678 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01678 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01678 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01678 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01678 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01678 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01678 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01678 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01678 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01678 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01678 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01678 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01678 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms