Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01667 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01667 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01667 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01667 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01667 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01667 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01667 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01667 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01667 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01667 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01667 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01667 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01667 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01667 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01667 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01667 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01667 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01667 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01667 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01667 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01667 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01667 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01667 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01667 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01667 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01667 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01667 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01667 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01667 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01667 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01667 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01667 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01667 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01667 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01667 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01667 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01667 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01667 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01667 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01667 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01667 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01667 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01667 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01667 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01667 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01667 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01667 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01667 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01667 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01667 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01667 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01667 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01667 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01667 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01667 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01667 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01667 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01667 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01667 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01667 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01667 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01667 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01667 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01667 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01667 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01667 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01667 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01667 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01667 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01667 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01667 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01667 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01667 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01667 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01667 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01667 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01667 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01667 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01667 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01667 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01667 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01667 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01667 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01667 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01667 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P01667 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01667 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01667 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01667 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01667 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01667 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01667 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01667 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01667 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01667 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01667 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01667 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01667 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01667 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms