Protein–RNA interactions for Protein: P01662

Ig kappa chain V-III region ABPC 22/PC 9245, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01662 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01662 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01662 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01662 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01662 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01662 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01662 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01662 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01662 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01662 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01662 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01662 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01662 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01662 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01662 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01662 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01662 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01662 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01662 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01662 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01662 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01662 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01662 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01662 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01662 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01662 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01662 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01662 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01662 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01662 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01662 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01662 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01662 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01662 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01662 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01662 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01662 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01662 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01662 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01662 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01662 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01662 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01662 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01662 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01662 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01662 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01662 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01662 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01662 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01662 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01662 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01662 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01662 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01662 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01662 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01662 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01662 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01662 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01662 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01662 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01662 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01662 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01662 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01662 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01662 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01662 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01662 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01662 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01662 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01662 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01662 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01662 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01662 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01662 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01662 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01662 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01662 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P01662 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01662 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01662 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01662 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01662 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01662 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01662 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01662 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01662 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01662 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01662 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01662 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01662 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01662 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01662 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01662 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01662 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01662 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01662 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01662 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01662 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01662 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01662 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms