Protein–RNA interactions for Protein: P01661

Ig kappa chain V-III region MOPC 63, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01661 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01661 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01661 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01661 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01661 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01661 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01661 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01661 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01661 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01661 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01661 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01661 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01661 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01661 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01661 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01661 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01661 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01661 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01661 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01661 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01661 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01661 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01661 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01661 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01661 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01661 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01661 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01661 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01661 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01661 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01661 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01661 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01661 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01661 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01661 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01661 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01661 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01661 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01661 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01661 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01661 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01661 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01661 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01661 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01661 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01661 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01661 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01661 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01661 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01661 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01661 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01661 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01661 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01661 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01661 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01661 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01661 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01661 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01661 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01661 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01661 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01661 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01661 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01661 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01661 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01661 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01661 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01661 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01661 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01661 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01661 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01661 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01661 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01661 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01661 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01661 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01661 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01661 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P01661 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01661 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01661 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01661 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01661 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01661 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01661 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01661 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01661 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01661 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01661 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01661 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01661 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01661 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01661 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01661 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01661 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01661 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01661 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01661 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01661 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01661 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms