Protein–RNA interactions for Protein: P01650

Ig kappa chain V-V region UPC 61, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01650 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01650 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01650 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01650 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01650 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01650 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01650 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01650 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01650 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01650 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01650 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01650 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01650 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01650 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01650 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01650 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01650 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01650 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01650 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01650 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01650 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01650 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01650 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01650 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01650 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01650 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01650 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01650 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01650 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01650 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01650 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01650 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01650 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01650 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01650 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01650 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01650 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01650 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01650 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01650 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01650 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01650 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01650 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01650 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01650 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01650 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01650 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01650 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01650 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01650 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01650 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01650 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01650 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01650 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01650 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
P01650 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01650 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01650 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
P01650 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
P01650 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
P01650 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01650 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01650 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01650 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01650 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01650 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01650 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01650 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
P01650 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01650 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01650 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01650 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01650 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01650 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01650 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
P01650 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
P01650 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01650 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01650 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
P01650 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01650 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01650 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01650 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01650 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01650 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01650 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01650 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01650 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01650 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01650 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01650 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01650 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01650 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01650 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01650 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01650 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01650 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01650 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01650 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
P01650 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms