Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01638 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01638 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01638 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01638 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01638 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01638 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01638 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01638 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01638 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01638 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01638 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01638 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01638 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01638 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01638 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01638 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01638 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01638 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01638 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01638 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01638 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01638 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01638 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01638 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01638 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01638 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01638 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01638 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01638 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01638 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01638 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01638 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01638 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01638 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01638 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01638 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01638 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01638 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01638 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01638 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01638 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01638 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01638 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01638 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01638 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01638 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01638 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01638 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01638 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01638 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01638 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01638 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01638 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01638 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01638 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01638 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01638 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01638 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01638 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01638 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01638 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01638 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01638 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01638 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01638 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01638 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01638 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01638 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01638 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01638 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01638 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01638 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01638 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01638 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01638 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01638 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01638 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01638 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01638 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01638 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01638 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01638 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01638 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01638 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01638 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01638 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01638 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01638 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01638 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01638 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01638 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01638 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01638 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01638 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01638 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01638 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01638 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01638 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01638 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms