Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms