Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JtbO88824 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JtbO88824 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JtbO88824 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JtbO88824 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JtbO88824 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JtbO88824 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JtbO88824 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JtbO88824 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JtbO88824 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JtbO88824 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JtbO88824 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JtbO88824 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JtbO88824 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JtbO88824 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JtbO88824 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JtbO88824 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JtbO88824 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JtbO88824 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JtbO88824 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JtbO88824 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JtbO88824 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JtbO88824 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JtbO88824 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JtbO88824 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JtbO88824 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JtbO88824 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JtbO88824 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JtbO88824 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JtbO88824 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JtbO88824 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JtbO88824 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JtbO88824 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JtbO88824 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JtbO88824 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
JtbO88824 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
JtbO88824 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JtbO88824 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
JtbO88824 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
JtbO88824 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
JtbO88824 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
JtbO88824 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JtbO88824 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JtbO88824 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JtbO88824 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JtbO88824 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JtbO88824 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JtbO88824 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
JtbO88824 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JtbO88824 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JtbO88824 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
JtbO88824 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JtbO88824 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JtbO88824 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JtbO88824 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
JtbO88824 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JtbO88824 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JtbO88824 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JtbO88824 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JtbO88824 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JtbO88824 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JtbO88824 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JtbO88824 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JtbO88824 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JtbO88824 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JtbO88824 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JtbO88824 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JtbO88824 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
JtbO88824 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
JtbO88824 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JtbO88824 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
JtbO88824 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JtbO88824 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JtbO88824 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JtbO88824 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JtbO88824 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
JtbO88824 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
JtbO88824 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
JtbO88824 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
JtbO88824 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JtbO88824 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JtbO88824 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JtbO88824 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
JtbO88824 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JtbO88824 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
JtbO88824 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JtbO88824 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JtbO88824 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JtbO88824 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JtbO88824 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JtbO88824 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JtbO88824 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JtbO88824 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JtbO88824 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JtbO88824 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JtbO88824 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JtbO88824 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
JtbO88824 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JtbO88824 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JtbO88824 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms