Protein–RNA interactions for Protein: O88705

Hcn3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn3O88705 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcn3O88705 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms