Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BlmO88700 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BlmO88700 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BlmO88700 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
BlmO88700 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
BlmO88700 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
BlmO88700 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BlmO88700 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
BlmO88700 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BlmO88700 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BlmO88700 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BlmO88700 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BlmO88700 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BlmO88700 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BlmO88700 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BlmO88700 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BlmO88700 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BlmO88700 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BlmO88700 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BlmO88700 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BlmO88700 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BlmO88700 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BlmO88700 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BlmO88700 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BlmO88700 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BlmO88700 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BlmO88700 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BlmO88700 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BlmO88700 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BlmO88700 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BlmO88700 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BlmO88700 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BlmO88700 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BlmO88700 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BlmO88700 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BlmO88700 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BlmO88700 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BlmO88700 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BlmO88700 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
BlmO88700 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BlmO88700 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BlmO88700 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BlmO88700 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
BlmO88700 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BlmO88700 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BlmO88700 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BlmO88700 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BlmO88700 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BlmO88700 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BlmO88700 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
BlmO88700 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BlmO88700 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BlmO88700 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BlmO88700 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BlmO88700 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BlmO88700 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BlmO88700 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BlmO88700 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BlmO88700 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
BlmO88700 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
BlmO88700 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BlmO88700 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BlmO88700 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BlmO88700 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BlmO88700 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BlmO88700 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BlmO88700 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BlmO88700 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BlmO88700 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BlmO88700 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BlmO88700 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BlmO88700 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BlmO88700 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BlmO88700 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
BlmO88700 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BlmO88700 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BlmO88700 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BlmO88700 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BlmO88700 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BlmO88700 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BlmO88700 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
BlmO88700 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
BlmO88700 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
BlmO88700 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BlmO88700 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BlmO88700 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BlmO88700 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BlmO88700 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BlmO88700 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BlmO88700 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BlmO88700 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BlmO88700 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BlmO88700 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BlmO88700 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BlmO88700 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BlmO88700 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BlmO88700 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BlmO88700 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BlmO88700 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
BlmO88700 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms