Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dll3O88516 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dll3O88516 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dll3O88516 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dll3O88516 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dll3O88516 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Dll3O88516 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dll3O88516 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dll3O88516 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dll3O88516 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dll3O88516 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dll3O88516 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dll3O88516 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dll3O88516 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dll3O88516 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dll3O88516 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dll3O88516 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dll3O88516 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Dll3O88516 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dll3O88516 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dll3O88516 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dll3O88516 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dll3O88516 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Dll3O88516 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Dll3O88516 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Dll3O88516 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dll3O88516 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dll3O88516 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dll3O88516 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dll3O88516 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dll3O88516 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dll3O88516 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dll3O88516 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dll3O88516 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dll3O88516 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dll3O88516 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dll3O88516 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dll3O88516 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dll3O88516 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Dll3O88516 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dll3O88516 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dll3O88516 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dll3O88516 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms