Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3aO88508 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3aO88508 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3aO88508 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3aO88508 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3aO88508 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3aO88508 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3aO88508 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3aO88508 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3aO88508 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3aO88508 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3aO88508 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3aO88508 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3aO88508 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3aO88508 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3aO88508 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3aO88508 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3aO88508 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3aO88508 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3aO88508 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3aO88508 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3aO88508 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3aO88508 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3aO88508 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3aO88508 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3aO88508 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3aO88508 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3aO88508 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3aO88508 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3aO88508 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3aO88508 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3aO88508 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3aO88508 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3aO88508 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3aO88508 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3aO88508 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3aO88508 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3aO88508 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3aO88508 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3aO88508 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms