Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkcO88445 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AurkcO88445 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AurkcO88445 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AurkcO88445 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AurkcO88445 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AurkcO88445 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
AurkcO88445 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
AurkcO88445 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms