Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vti1bO88384 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vti1bO88384 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vti1bO88384 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vti1bO88384 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vti1bO88384 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vti1bO88384 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vti1bO88384 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vti1bO88384 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vti1bO88384 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vti1bO88384 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vti1bO88384 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vti1bO88384 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vti1bO88384 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vti1bO88384 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vti1bO88384 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vti1bO88384 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vti1bO88384 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vti1bO88384 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vti1bO88384 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vti1bO88384 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vti1bO88384 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vti1bO88384 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vti1bO88384 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vti1bO88384 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms