Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnnal1O88327 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnal1O88327 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms