Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfdp1O88271 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfdp1O88271 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cfdp1O88271 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfdp1O88271 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms