Protein–RNA interactions for Protein: O70435

Psma3, Proteasome subunit alpha type-3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma3O70435 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma3O70435 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma3O70435 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma3O70435 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psma3O70435 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma3O70435 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma3O70435 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma3O70435 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psma3O70435 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma3O70435 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma3O70435 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma3O70435 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma3O70435 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma3O70435 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma3O70435 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma3O70435 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma3O70435 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma3O70435 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma3O70435 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma3O70435 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma3O70435 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma3O70435 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma3O70435 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma3O70435 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms