Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lnx1O70263 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lnx1O70263 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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