Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx4O55187 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx4O55187 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms