Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrxO55103 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrxO55103 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrxO55103 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrxO55103 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrxO55103 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrxO55103 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrxO55103 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrxO55103 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrxO55103 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrxO55103 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrxO55103 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrxO55103 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrxO55103 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrxO55103 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrxO55103 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrxO55103 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrxO55103 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PrxO55103 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrxO55103 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PrxO55103 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PrxO55103 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PrxO55103 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PrxO55103 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PrxO55103 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrxO55103 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrxO55103 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrxO55103 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrxO55103 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrxO55103 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrxO55103 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrxO55103 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrxO55103 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrxO55103 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrxO55103 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrxO55103 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrxO55103 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrxO55103 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrxO55103 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrxO55103 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrxO55103 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrxO55103 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrxO55103 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrxO55103 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrxO55103 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrxO55103 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrxO55103 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrxO55103 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrxO55103 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrxO55103 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrxO55103 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrxO55103 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrxO55103 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrxO55103 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrxO55103 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PrxO55103 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrxO55103 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrxO55103 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrxO55103 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrxO55103 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrxO55103 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrxO55103 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrxO55103 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrxO55103 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrxO55103 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrxO55103 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrxO55103 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrxO55103 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrxO55103 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrxO55103 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrxO55103 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrxO55103 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrxO55103 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrxO55103 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrxO55103 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrxO55103 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrxO55103 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrxO55103 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PrxO55103 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrxO55103 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrxO55103 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrxO55103 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrxO55103 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PrxO55103 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrxO55103 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrxO55103 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrxO55103 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrxO55103 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrxO55103 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrxO55103 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrxO55103 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrxO55103 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrxO55103 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrxO55103 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PrxO55103 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrxO55103 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrxO55103 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PrxO55103 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrxO55103 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrxO55103 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms