Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr1O55100 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms