Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms