Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole2O54956 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole2O54956 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole2O54956 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole2O54956 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole2O54956 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole2O54956 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole2O54956 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole2O54956 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole2O54956 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole2O54956 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pole2O54956 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms