Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmb10O35955 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb10O35955 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms