Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pik3cdO35904 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pik3cdO35904 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms